Un nouvel emplacement fût choisi et une nouvelle école y fût construite en 1939. Elle est située au 32 du chemin de Montréal, côté est. À ses débuts, elle comprenait 6 classes et une résidence pour les frères.
Souvent l'école St-Jean-de-Brébeuf était nommée « Collège des gars » et l'école Notre-Dame-Auxiliatrice « Couvent des filles ». Les filles et les garçons ne fréquentaient pas la même école à cette époque, sauf durant une courte période, en 1950-1951 où, afin de répondre à un manque d'espace, les classes de première et deuxième année, ont été reçues chez les soeurs. À Masson, les écoles mixtes ont été ouvertes vers la fin des années 1960.
Une nouvelle aile fût construite en 1955. Un agrandissement qui comprenait huit classes et une salle de récréation.
( photo de gc )
Finalement en 1998-1999, une nouvelle construction fût annexée à l'école St-Jean-de-Brébeuf, pour y aménager un gymnase et une bibliothèque. Cette dernière construction fut réalisé conjointement par la commission scolaire et la municipalité.